太古の昔、地球は活気に満ち、機械文明は高度に発達していました。
しかしある日、魔導メカが人類を裏切り、深刻な災害をもたらします。
災害の脅威に立ち向かうため、魔導メカと生き残った人々は、新たな聖域「OSの街」を築き上げます。
百年後、研究者たちは、災害の秘密が遺跡に隠されていることを発見します。
まさにこの決定的な瞬間、OSのリーダーたちが遺跡探索中に事故で行方不明になります。
そのせいで、OSと敵の間の状況は激化し、戦争の危機が迫ります。
1991年SOFTSTARよりZYCAの世界観を継承。